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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
10/06/2016 |
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Data da última atualização: |
08/11/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. |
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Afiliação: |
DAIVA DOMENECH TUPINAMBÁ, UCB; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; OHANA YONARA ASSIS COSTA, UCB; JÉSSICA CARVALHO BERGMANN, UCB; RICARDO HENRIQUE KRUGER, UNB; CYNTHIA MARIA KYAW, UNB; CRISTINE CHAVES BARRETO, UCB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE. |
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Título: |
Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied. |
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Palavras-Chave: |
Archaeal; Área adjacente sob cultivo; Comunidades arcaicas; Comunidades microbianas; Floresta amazônica; Genômica; Mata nativa; Óleo de palma; Palma de óleo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02341naa a2200325 a 4500
001 2046765
005 2016-11-08
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159$2DOI
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520 $aAbstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
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| Registros recuperados : 18 | |
| 4. |  | TUPINAMBÁ, D. D.; PALUAN, S. de F.; COSTA, O. Y. A.; BITENCOURT, A. C.; BERGMANN, J. C.; QUIRINO, B. F. Utilização da diversidade microbiana brasileira para a produção de etanol a partir de biomassa lignocelulósica. Microbiologia in Foco, São Paulo, ano 5, n. 21, p. 19-32, 2013.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 6. | | TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | CUNHA, I. S.; BARRETO, C. C.; COSTA, O. Y. A.; BOMFIM, M. A. D.; CASTRO, A. P. de; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Bacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil. Anaerobe, London, v. 17, n. 3, p. 118-124, Jul. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D. D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Avaliação da diversidade microbiana do processo de produção de etanol de cana-de-açúcar por meio de abordagem independente de cultivo. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 111 - 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 9. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; RAMOS, N. S. P. L.; FURTADO, R. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construction of metagenomic libraries with large inserts of DNA from the Amazonian soil microbiota and screening for enzymes with biotechnological potential. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programas e resumos... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 64-65.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 10. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BERGMANN, J. C.; KYAW, C. M.; KRUGGER, R. H.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Microbial diversity in sugarcane ethanol production in a Brazilian distillery using a culture-independent method. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, Epub ahead of print, 18 Nov. 2014. Não paginado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 11. | | QUIRINO, B. F.; BERGMAN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; PALUAN, S. G.; RAMOS, N. S. P. L.; SOUTO, B. de M.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Identification of glycosyl hydrolases in the microbial biodiversity of Brazil using a metagenomic approach. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 34., 2012, New Orleans. [Anais...]. Fairfax, VA: Society for Industrial Microbiology & Biotechnology, 2012. Não paginado. Poster Session 1: 7-44.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 12. | | QUIRINO, B. F.; CUNHA, I. S.; SOUTO, B. de M.; CARVALHO, L. S.; RAMOS, N. S. P. L.; COSTA, O. Y. A.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Characterization of the bacterial diversity in the goat rumen and identification of enzymes with potential use in the biofuels industry. In: ANNUAL MEETING AND EXHIBITION, 60., 2010, San Francisco, CA. Industrial microbiology and biotechnology. [S.l]: Society for Industrial Microbiology, 2010. p. 107 Poster abstract P9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 13. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; GLADDEN, J. M.; SINGER, S.; HEINS, R.; D'HAESELEER, P.; SIMMONS, B. A.; QUIRINO, B. F. Discovery of two novel b-glucosidases from an amazon soil metagenomic library. FEMS Microbiology Letters, 16 de dezembro, p. 1-9, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 14. | | RODRIGUES, G. R.; PINTO, O. H. B.; SCHROEDER, L. F.; FERNANDES, G. da R.; COSTA, O. Y. A.; QUIRINO, B. F.; KURAMAE, E. E.; BARRETO, C. C. Unraveling the xylanolytic potential of Acidobacteria bacterium AB60 from Cerrado soils. FEMS Microbiology Letters, v. 367, Issue 18, fnaa149, Sept. 2020. 367| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 15. | | BITENCOURT, A. C.; PORTELA, G. C.; SOUTO, B. de M.; COSTA, O. Y. A.; FAVARO, L. C. de L.; MENDES, T. D.; RODRIGUES, D. de S.; QUIRINO, B. F. Cellulolytic and accessory enzimes from brazilian microbiota for biomass deconstruction. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 106 - 108| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 16. | | KIELAK, A. M.; CASTELLANE, T. C. L.; CAMPANHARO, J. C.; COLNAGO, L. A.; COSTA, O. Y. A.; SILVA, M. L. C.; VAN VEEN, J. A.; LEMOS, E. G. M.; KURAMAE, E. E. Characterization of novel Acidobacteria exopolysaccharides with potential industrial and ecological applications. In: Scientific Reports, v. 7, 2017. Article 41193.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 17. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BERGMANN, J. C.; BITENCOURT, A. C. A.; MOURA, C.; SCHROEDER, L. F.; FRANCO, O. L.; QUIRINO, B. F. Microbial diversity in different stages of the ethanol production process using traditional techniques and molecular biology. In: REUNIÃO ANUAL DA SBBQ, 42., 2013, Foz do Iguaçu, PR. [Anais...] São Paulo: SBBq, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 18. | | RODRIGUES, L. P.; SCHROEDER, L. F.; RAMOS, N. S. P. L.; RAMOS, T. G.; MOURA, C. O.; SOUTO, B. de M.; BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; JUNIOR, D. A. J.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Prospecção de celulases e hemicelulases utilizando diferentes substratos por abordagem metagenômica. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos, SP. [Anais...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Asociación Latinoamericana de Microbiologia, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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